Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA1P42261 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA1P42261 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GRIA1P42261 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA1P42261 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA1P42261 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA1P42261 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GRIA1P42261 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA1P42261 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms