Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTNNB1P35222 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNNB1P35222 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms