Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL9P32969 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL9P32969 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPL9P32969 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPL9P32969 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL9P32969 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL9P32969 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL9P32969 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL9P32969 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL9P32969 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL9P32969 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL9P32969 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL9P32969 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL9P32969 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL9P32969 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL9P32969 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL9P32969 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL9P32969 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL9P32969 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL9P32969 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL9P32969 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL9P32969 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL9P32969 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL9P32969 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL9P32969 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL9P32969 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL9P32969 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL9P32969 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL9P32969 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL9P32969 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL9P32969 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL9P32969 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL9P32969 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL9P32969 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL9P32969 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL9P32969 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL9P32969 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL9P32969 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL9P32969 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL9P32969 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL9P32969 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL9P32969 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL9P32969 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL9P32969 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL9P32969 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL9P32969 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL9P32969 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL9P32969 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL9P32969 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL9P32969 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL9P32969 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL9P32969 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms