Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD34P28906 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD34P28906 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD34P28906 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD34P28906 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD34P28906 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD34P28906 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD34P28906 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD34P28906 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD34P28906 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD34P28906 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD34P28906 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD34P28906 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD34P28906 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD34P28906 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD34P28906 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD34P28906 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD34P28906 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD34P28906 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CD34P28906 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CD34P28906 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD34P28906 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD34P28906 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD34P28906 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD34P28906 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms