Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUSP1P28562 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP1P28562 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms