Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HMGB2P26583 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HMGB2P26583 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms