Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 ATP5B-207ENST00000551020 856 ntTSL 318.44■□□□□ 0.543e-22■■■■■ 28.3
RPS3P23396 LCP1-203ENST00000416500 819 ntTSL 38.74□□□□□ -1.017e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 DLD-213ENST00000494441 707 ntTSL 318.71■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 28.3
RPS3P23396 RETSAT-207ENST00000490291 660 ntTSL 213.05□□□□□ -0.327e-7■■■■■ 28.3
RPS3P23396 PHGDH-234ENST00000642041 943 nt17.04■□□□□ 0.327e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 PHGDH-221ENST00000641573 1180 nt12.98□□□□□ -0.337e-8■■■■■ 28.3
RPS3P23396 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.278e-7■■■■■ 28.3
RPS3P23396 ATP5A1-209ENST00000589611 995 ntTSL 29.38□□□□□ -0.915e-10■■■■■ 28.3
RPS3P23396 CES2-211ENST00000568470 3391 ntTSL 211.27□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 28.3
RPS3P23396 CES2-202ENST00000417689 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 28.3
RPS3P23396 CES2-201ENST00000317091 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 28.3
RPS3P23396 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.336e-7■■■■■ 28.3
RPS3P23396 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.386e-7■■■■■ 28.3
RPS3P23396 CTNNB1-212ENST00000471014 607 ntTSL 312.22□□□□□ -0.454e-15■■■■■ 28.3
RPS3P23396 SLC47A1-212ENST00000576095 548 ntTSL 415.04■□□□□ -05e-7■■■■■ 28.3
RPS3P23396 SLC47A1-214ENST00000584348 603 ntTSL 310.52□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 28.3
RPS3P23396 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.952e-8■■■■■ 28.2
RPS3P23396 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.712e-8■■■■■ 28.2
RPS3P23396 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.262e-8■■■■■ 28.2
RPS3P23396 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 28.2
RPS3P23396 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 28.2
RPS3P23396 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 28.2
RPS3P23396 ATP5B-202ENST00000547250 840 ntTSL 59.13□□□□□ -0.953e-22■■■■■ 28.2
RPS3P23396 BSG-205ENST00000571735 2155 ntTSL 215.87■□□□□ 0.132e-19■■■■■ 28.2
RPS3P23396 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 28.2
RPS3P23396 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 28.2
RPS3P23396 TFR2-206ENST00000465294 2763 ntTSL 213.2□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 28.2
RPS3P23396 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.016e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.666e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.526e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 HMBS-226ENST00000640813 1283 ntTSL 518.13■□□□□ 0.496e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.26e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 HMBS-224ENST00000546226 2112 ntTSL 214.92□□□□□ -0.026e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 HMBS-217ENST00000543543 1796 ntTSL 510.94□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 DIAPH1-205ENST00000448451 2102 ntTSL 213.68□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 DIAPH1-208ENST00000476339 2606 ntTSL 211.12□□□□□ -0.636e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 PSMB4-206ENST00000495288 986 ntTSL 217.36■□□□□ 0.376e-8■■■■■ 28.2
RPS3P23396 PSMB4-207ENST00000495805 811 ntTSL 213.18□□□□□ -0.36e-8■■■■■ 28.2
RPS3P23396 CAPNS1-203ENST00000586963 570 ntTSL 27.65□□□□□ -1.184e-9■■■■■ 28.2
RPS3P23396 BSG-211ENST00000576984 544 ntTSL 418.8■□□□□ 0.65e-33■■■■■ 28.2
RPS3P23396 FARSA-203ENST00000586146 1707 ntTSL 521.63■■□□□ 1.056e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.946e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 FARSA-208ENST00000588965 1831 ntTSL 519.58■□□□□ 0.736e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.656e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.566e-7■■■■■ 28.2
RPS3P23396 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.163e-10■■■■■ 28.1
RPS3P23396 RPS17-205ENST00000560229 776 ntTSL 1 (best)12.94□□□□□ -0.343e-10■■■■■ 28.1
RPS3P23396 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.133e-10■■■■■ 28.1
RPS3P23396 RPS17-207ENST00000560639 932 ntTSL 54.61□□□□□ -1.673e-10■■■■■ 28.1
RPS3P23396 RPS17-202ENST00000558397 583 ntTSL 34.59□□□□□ -1.673e-10■■■■■ 28.1
RPS3P23396 GSN-212ENST00000477863 716 ntTSL 415.39■□□□□ 0.057e-16■■■■■ 28.1
RPS3P23396 GSN-210ENST00000477104 806 ntTSL 414.48□□□□□ -0.097e-16■■■■■ 28.1
RPS3P23396 PCK2-207ENST00000559171 508 ntTSL 313.18□□□□□ -0.31e-16■■■■■ 28.1
RPS3P23396 LCP1-207ENST00000494531 537 ntTSL 37.85□□□□□ -1.159e-8■■■■■ 28.1
RPS3P23396 SLC16A1-205ENST00000478835 452 ntTSL 1 (best)11.54□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 28.1
RPS3P23396 SLC38A10-203ENST00000539643 1988 ntTSL 1 (best)17.83■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 28.1
RPS3P23396 SEZ6L2-206ENST00000563118 909 ntTSL 517.92■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 28.1
RPS3P23396 PSMA4-215ENST00000559934 2741 ntTSL 1 (best)21.1■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 28.1
RPS3P23396 PSMA4-216ENST00000559948 710 ntTSL 58.4□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 28.1
RPS3P23396 PSMA4-210ENST00000559146 674 ntTSL 27.48□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 28.1
RPS3P23396 PSMA4-203ENST00000557929 635 ntTSL 55.87□□□□□ -1.472e-7■■■■■ 28.1
RPS3P23396 RPL15-206ENST00000422218 588 ntTSL 416.9■□□□□ 0.37e-15■■■■■ 28.1
RPS3P23396 TMEM2-211ENST00000543165 542 ntTSL 213.32□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 28.1
RPS3P23396 TMEM2-212ENST00000545719 533 ntTSL 44.01□□□□□ -1.772e-9■■■■■ 28.1
RPS3P23396 GSTP1-204ENST00000489040 523 ntTSL 213.91□□□□□ -0.185e-20■■■■■ 28.1
RPS3P23396 UROD-203ENST00000434478 600 ntTSL 311.13□□□□□ -0.636e-10■■■■■ 28.1
RPS3P23396 EIF4A1-216ENST00000580888 710 ntTSL 217.63■□□□□ 0.412e-12■■■■■ 28
RPS3P23396 EIF4A1-236ENST00000584901 1021 ntTSL 211.21□□□□□ -0.612e-12■■■■■ 28
RPS3P23396 EIF4A1-229ENST00000583802 563 ntTSL 410.67□□□□□ -0.72e-12■■■■■ 28
RPS3P23396 EIF4A1-237ENST00000585024 577 ntTSL 48.1□□□□□ -1.112e-12■■■■■ 28
RPS3P23396 SLC30A5-204ENST00000504103 382 ntTSL 321.56■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 28
RPS3P23396 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.031e-6■■■■■ 28
RPS3P23396 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 28
RPS3P23396 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 28
RPS3P23396 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 28
RPS3P23396 AMBP-204ENST00000603230 1057 ntTSL 1 (best)14.94□□□□□ -0.021e-52■■■■■ 28
RPS3P23396 GOT1-202ENST00000471741 716 ntTSL 210.3□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 28
RPS3P23396 LMAN2-204ENST00000504071 562 ntTSL 218.05■□□□□ 0.483e-8■■■■■ 28
RPS3P23396 ATP5A1-205ENST00000586592 2214 ntTSL 223.15■■□□□ 1.32e-7■■■■■ 28
RPS3P23396 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.212e-7■■■■■ 28
RPS3P23396 ATP5A1-211ENST00000590156 1931 ntTSL 214.08□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 28
RPS3P23396 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 28
RPS3P23396 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 28
RPS3P23396 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 28
RPS3P23396 LDHB-204ENST00000450584 732 ntTSL 39.62□□□□□ -0.876e-7■■■■■ 28
RPS3P23396 ABCB6-209ENST00000492543 806 ntTSL 517.15■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 28
RPS3P23396 ABCB6-204ENST00000443805 679 ntTSL 214.85□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 28
RPS3P23396 ABCB6-207ENST00000485773 962 ntTSL 213.22□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 28
RPS3P23396 ABCB6-208ENST00000487380 768 ntTSL 212.05□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 28
RPS3P23396 HIST1H2BG-201ENST00000541790 1534 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.526e-13■■■■■ 27.9
RPS3P23396 SEZ6L2-208ENST00000568407 1068 ntTSL 315.52■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 27.9
RPS3P23396 COPB1-204ENST00000526191 697 ntTSL 23.36□□□□□ -1.876e-18■■■■■ 27.9
RPS3P23396 HEXA-204ENST00000564677 572 ntTSL 213.06□□□□□ -0.325e-9■■■■■ 27.9
RPS3P23396 HEXA-205ENST00000565873 721 ntTSL 29.97□□□□□ -0.815e-9■■■■■ 27.9
RPS3P23396 PLA2G15-206ENST00000564827 781 ntTSL 518.59■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 27.9
RPS3P23396 PLA2G15-211ENST00000568082 929 ntTSL 515.71■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 27.9
RPS3P23396 PLA2G15-208ENST00000565744 577 ntTSL 414.26□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 27.9
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