Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBG1P23258 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBG1P23258 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms