Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNA1P20827 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNA1P20827 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms