Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NTF3P20783 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTF3P20783 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF3P20783 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF3P20783 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF3P20783 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF3P20783 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF3P20783 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF3P20783 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF3P20783 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF3P20783 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTF3P20783 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NTF3P20783 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NTF3P20783 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTF3P20783 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms