Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF6P18850 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF6P18850 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF6P18850 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF6P18850 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF6P18850 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF6P18850 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF6P18850 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF6P18850 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF6P18850 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF6P18850 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF6P18850 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF6P18850 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATF6P18850 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF6P18850 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF6P18850 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF6P18850 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF6P18850 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF6P18850 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF6P18850 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF6P18850 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF6P18850 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF6P18850 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATF6P18850 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATF6P18850 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF6P18850 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF6P18850 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF6P18850 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF6P18850 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF6P18850 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF6P18850 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF6P18850 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF6P18850 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF6P18850 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATF6P18850 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6P18850 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6P18850 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6P18850 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6P18850 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6P18850 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6P18850 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6P18850 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6P18850 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6P18850 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6P18850 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6P18850 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6P18850 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6P18850 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6P18850 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATF6P18850 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATF6P18850 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms