Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCP1P17987 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCP1P17987 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCP1P17987 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TCP1P17987 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCP1P17987 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCP1P17987 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCP1P17987 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCP1P17987 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCP1P17987 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCP1P17987 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCP1P17987 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCP1P17987 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCP1P17987 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCP1P17987 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCP1P17987 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCP1P17987 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCP1P17987 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCP1P17987 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCP1P17987 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCP1P17987 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCP1P17987 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCP1P17987 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCP1P17987 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCP1P17987 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCP1P17987 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCP1P17987 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCP1P17987 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCP1P17987 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCP1P17987 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TCP1P17987 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCP1P17987 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCP1P17987 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCP1P17987 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCP1P17987 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCP1P17987 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCP1P17987 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCP1P17987 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCP1P17987 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCP1P17987 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCP1P17987 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCP1P17987 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCP1P17987 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCP1P17987 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCP1P17987 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCP1P17987 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCP1P17987 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCP1P17987 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCP1P17987 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCP1P17987 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCP1P17987 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCP1P17987 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCP1P17987 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCP1P17987 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCP1P17987 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCP1P17987 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCP1P17987 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCP1P17987 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCP1P17987 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCP1P17987 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCP1P17987 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCP1P17987 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCP1P17987 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCP1P17987 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCP1P17987 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TCP1P17987 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms