Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN2P17655 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN2P17655 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms