Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMPD1P17405 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPD1P17405 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms