Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD44P16070 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD44P16070 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD44P16070 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD44P16070 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD44P16070 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD44P16070 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD44P16070 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD44P16070 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD44P16070 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD44P16070 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD44P16070 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD44P16070 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CD44P16070 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD44P16070 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD44P16070 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD44P16070 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD44P16070 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD44P16070 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD44P16070 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD44P16070 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD44P16070 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD44P16070 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD44P16070 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD44P16070 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD44P16070 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD44P16070 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD44P16070 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD44P16070 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD44P16070 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD44P16070 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD44P16070 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD44P16070 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD44P16070 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD44P16070 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CD44P16070 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD44P16070 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD44P16070 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD44P16070 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD44P16070 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD44P16070 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD44P16070 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD44P16070 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD44P16070 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD44P16070 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD44P16070 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD44P16070 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD44P16070 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CD44P16070 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CD44P16070 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD44P16070 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD44P16070 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD44P16070 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD44P16070 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD44P16070 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD44P16070 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD44P16070 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD44P16070 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD44P16070 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD44P16070 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD44P16070 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD44P16070 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD44P16070 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CD44P16070 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD44P16070 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD44P16070 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD44P16070 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD44P16070 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD44P16070 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD44P16070 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CD44P16070 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CD44P16070 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD44P16070 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD44P16070 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD44P16070 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD44P16070 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD44P16070 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD44P16070 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD44P16070 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD44P16070 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD44P16070 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD44P16070 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms