Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LYL1P12980 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LYL1P12980 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LYL1P12980 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LYL1P12980 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LYL1P12980 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LYL1P12980 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LYL1P12980 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LYL1P12980 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYL1P12980 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYL1P12980 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYL1P12980 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYL1P12980 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYL1P12980 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYL1P12980 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYL1P12980 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYL1P12980 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LYL1P12980 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYL1P12980 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYL1P12980 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LYL1P12980 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYL1P12980 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYL1P12980 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LYL1P12980 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LYL1P12980 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYL1P12980 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYL1P12980 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYL1P12980 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYL1P12980 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYL1P12980 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYL1P12980 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LYL1P12980 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYL1P12980 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LYL1P12980 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYL1P12980 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYL1P12980 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LYL1P12980 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms