Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKBP12277 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CKBP12277 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKBP12277 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CKBP12277 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKBP12277 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKBP12277 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKBP12277 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKBP12277 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKBP12277 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKBP12277 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKBP12277 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKBP12277 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKBP12277 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKBP12277 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CKBP12277 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKBP12277 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKBP12277 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CKBP12277 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKBP12277 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKBP12277 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKBP12277 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKBP12277 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKBP12277 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKBP12277 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKBP12277 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CKBP12277 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKBP12277 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKBP12277 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CKBP12277 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CKBP12277 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKBP12277 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKBP12277 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKBP12277 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKBP12277 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKBP12277 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKBP12277 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKBP12277 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKBP12277 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKBP12277 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CKBP12277 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKBP12277 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKBP12277 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKBP12277 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKBP12277 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKBP12277 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKBP12277 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKBP12277 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKBP12277 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKBP12277 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CKBP12277 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CKBP12277 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKBP12277 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKBP12277 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKBP12277 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKBP12277 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKBP12277 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKBP12277 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKBP12277 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CKBP12277 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKBP12277 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKBP12277 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKBP12277 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKBP12277 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKBP12277 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms