Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VPREB1P12018 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms