Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM225BP0DP42 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM225BP0DP42 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms