Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALB1P05937 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALB1P05937 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALB1P05937 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALB1P05937 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB1P05937 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB1P05937 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB1P05937 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB1P05937 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB1P05937 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB1P05937 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB1P05937 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB1P05937 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB1P05937 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB1P05937 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB1P05937 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALB1P05937 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB1P05937 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB1P05937 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB1P05937 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB1P05937 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB1P05937 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB1P05937 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB1P05937 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB1P05937 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB1P05937 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB1P05937 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB1P05937 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALB1P05937 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB1P05937 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB1P05937 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB1P05937 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB1P05937 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB1P05937 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB1P05937 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB1P05937 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB1P05937 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB1P05937 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB1P05937 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALB1P05937 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB1P05937 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB1P05937 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB1P05937 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB1P05937 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB1P05937 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB1P05937 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALB1P05937 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALB1P05937 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB1P05937 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB1P05937 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB1P05937 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB1P05937 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB1P05937 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB1P05937 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB1P05937 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB1P05937 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB1P05937 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB1P05937 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB1P05937 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB1P05937 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALB1P05937 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB1P05937 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALB1P05937 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms