Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDN1P05305 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDN1P05305 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDN1P05305 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDN1P05305 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDN1P05305 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDN1P05305 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDN1P05305 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDN1P05305 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDN1P05305 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDN1P05305 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDN1P05305 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDN1P05305 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EDN1P05305 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDN1P05305 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDN1P05305 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDN1P05305 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDN1P05305 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDN1P05305 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDN1P05305 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDN1P05305 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDN1P05305 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDN1P05305 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EDN1P05305 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDN1P05305 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDN1P05305 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDN1P05305 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDN1P05305 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDN1P05305 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDN1P05305 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDN1P05305 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDN1P05305 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDN1P05305 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EDN1P05305 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDN1P05305 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDN1P05305 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EDN1P05305 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EDN1P05305 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EDN1P05305 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDN1P05305 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDN1P05305 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDN1P05305 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDN1P05305 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDN1P05305 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDN1P05305 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDN1P05305 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDN1P05305 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDN1P05305 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDN1P05305 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDN1P05305 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDN1P05305 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDN1P05305 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDN1P05305 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDN1P05305 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDN1P05305 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDN1P05305 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDN1P05305 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDN1P05305 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDN1P05305 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDN1P05305 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDN1P05305 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EDN1P05305 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDN1P05305 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDN1P05305 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EDN1P05305 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDN1P05305 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDN1P05305 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDN1P05305 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDN1P05305 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDN1P05305 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDN1P05305 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDN1P05305 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDN1P05305 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDN1P05305 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EDN1P05305 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDN1P05305 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDN1P05305 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDN1P05305 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDN1P05305 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDN1P05305 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDN1P05305 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms