Protein–RNA interactions for Protein: P01834

IGKC, Immunoglobulin kappa constant, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKCP01834 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKCP01834 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKCP01834 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKCP01834 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKCP01834 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGKCP01834 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGKCP01834 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IGKCP01834 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms