Protein–RNA interactions for Protein: P01737

T-cell receptor alpha chain V region PY14, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01737 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01737 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01737 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01737 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01737 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01737 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01737 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01737 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01737 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01737 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms