Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F9P00740 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F9P00740 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F9P00740 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F9P00740 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F9P00740 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F9P00740 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F9P00740 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F9P00740 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
F9P00740 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
F9P00740 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
F9P00740 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F9P00740 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
F9P00740 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F9P00740 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F9P00740 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F9P00740 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F9P00740 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
F9P00740 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
F9P00740 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F9P00740 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F9P00740 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
F9P00740 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
F9P00740 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F9P00740 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
F9P00740 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
F9P00740 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
F9P00740 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F9P00740 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F9P00740 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F9P00740 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
F9P00740 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F9P00740 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F9P00740 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F9P00740 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F9P00740 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F9P00740 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
F9P00740 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P00740 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P00740 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P00740 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P00740 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P00740 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P00740 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P00740 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P00740 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P00740 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P00740 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P00740 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P00740 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P00740 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P00740 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F9P00740 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P00740 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P00740 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P00740 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P00740 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P00740 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P00740 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P00740 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P00740 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F9P00740 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms