Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL1O95922 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL1O95922 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms