Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SEC24BO95487 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC24BO95487 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms