Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UFL1O94874 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UFL1O94874 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UFL1O94874 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UFL1O94874 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UFL1O94874 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UFL1O94874 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UFL1O94874 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UFL1O94874 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UFL1O94874 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UFL1O94874 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UFL1O94874 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UFL1O94874 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UFL1O94874 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UFL1O94874 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UFL1O94874 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UFL1O94874 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UFL1O94874 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UFL1O94874 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UFL1O94874 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UFL1O94874 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UFL1O94874 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UFL1O94874 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UFL1O94874 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UFL1O94874 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UFL1O94874 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UFL1O94874 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UFL1O94874 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UFL1O94874 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UFL1O94874 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UFL1O94874 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UFL1O94874 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UFL1O94874 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UFL1O94874 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UFL1O94874 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UFL1O94874 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UFL1O94874 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UFL1O94874 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UFL1O94874 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UFL1O94874 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
UFL1O94874 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UFL1O94874 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UFL1O94874 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UFL1O94874 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UFL1O94874 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UFL1O94874 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UFL1O94874 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UFL1O94874 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UFL1O94874 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UFL1O94874 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UFL1O94874 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UFL1O94874 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
UFL1O94874 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
UFL1O94874 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UFL1O94874 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UFL1O94874 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UFL1O94874 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UFL1O94874 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UFL1O94874 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UFL1O94874 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UFL1O94874 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UFL1O94874 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UFL1O94874 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UFL1O94874 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UFL1O94874 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UFL1O94874 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UFL1O94874 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UFL1O94874 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UFL1O94874 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UFL1O94874 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UFL1O94874 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UFL1O94874 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UFL1O94874 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UFL1O94874 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UFL1O94874 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UFL1O94874 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UFL1O94874 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UFL1O94874 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UFL1O94874 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UFL1O94874 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms