Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCKDKO14874 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCKDKO14874 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCKDKO14874 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BCKDKO14874 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCKDKO14874 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCKDKO14874 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCKDKO14874 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCKDKO14874 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCKDKO14874 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BCKDKO14874 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCKDKO14874 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCKDKO14874 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCKDKO14874 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BCKDKO14874 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BCKDKO14874 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BCKDKO14874 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms