Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H7C1D1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
H7C1D1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H7C1D1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H7C1D1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1D1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1D1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1D1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1D1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1D1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1D1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1D1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1D1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1D1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1D1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1D1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H7C1D1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1D1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1D1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1D1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1D1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1D1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1D1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1D1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1D1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1D1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1D1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1D1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1D1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H7C1D1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1D1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1D1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1D1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1D1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1D1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1D1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1D1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1D1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H7C1D1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1D1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1D1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1D1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1D1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1D1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1D1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1D1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1D1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1D1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
H7C1D1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1D1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1D1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1D1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1D1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1D1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1D1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1D1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1D1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1D1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1D1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H7C1D1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1D1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1D1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1D1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1D1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1D1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1D1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1D1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
H7C1D1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H7C1D1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1D1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1D1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1D1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1D1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1D1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1D1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1D1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1D1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H7C1D1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1D1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1D1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1D1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1D1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C1D1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms