Protein–RNA interactions for Protein: F8VVB4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VVB4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
F8VVB4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
F8VVB4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
F8VVB4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
F8VVB4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
F8VVB4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VVB4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VVB4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VVB4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VVB4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VVB4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VVB4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VVB4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VVB4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VVB4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
F8VVB4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VVB4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VVB4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VVB4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VVB4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VVB4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VVB4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VVB4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VVB4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VVB4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VVB4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VVB4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VVB4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VVB4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VVB4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
F8VVB4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8VVB4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8VVB4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8VVB4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
F8VVB4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8VVB4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
F8VVB4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms