Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPBD1B2RD01 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPBD1B2RD01 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms