Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NNZ2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NNZ2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NNZ2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NNZ2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NNZ2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NNZ2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A6NNZ2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NNZ2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NNZ2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NNZ2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NNZ2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NNZ2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NNZ2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NNZ2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NNZ2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NNZ2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A6NNZ2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NNZ2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NNZ2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NNZ2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NNZ2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NNZ2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NNZ2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NNZ2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A6NNZ2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A6NNZ2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A6NNZ2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A6NNZ2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A6NNZ2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A6NNZ2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNZ2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNZ2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNZ2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNZ2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNZ2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNZ2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNZ2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNZ2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNZ2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNZ2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNZ2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNZ2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNZ2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNZ2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A6NNZ2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NNZ2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NNZ2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
A6NNZ2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms