Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms