Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00862A6NCI5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00862A6NCI5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms