Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP3Q9Y6F1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PARP3Q9Y6F1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
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