Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC41.54■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
DCAF1Q9Y4B6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC41.49■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
DCAF1Q9Y4B6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms