Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms