Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC50.26■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC50.26■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC50.26■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC50.26■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC50.25■■■■■ 5.64
NISCHQ9Y2I1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC50.25■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC50.25■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC50.25■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC50.24■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC50.23■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC50.23■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC50.23■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC50.23■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC50.22■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC50.22■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC50.22■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.21■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC50.21■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.21■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.21■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC50.21■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC50.2■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.2■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC50.2■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.2■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.63
NISCHQ9Y2I1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.19■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC50.19■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC50.18■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC50.18■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.18■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC50.17■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC50.16■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC50.16■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.16■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC50.16■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC50.15■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.15■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC50.15■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC50.15■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC50.15■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC50.14■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC50.14■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC50.14■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC50.14■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC50.14■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC50.14■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC50.14■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.62
NISCHQ9Y2I1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
NISCHQ9Y2I1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
NISCHQ9Y2I1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC50.12■■■■■ 5.61
NISCHQ9Y2I1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC50.12■■■■■ 5.61
NISCHQ9Y2I1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC50.12■■■■■ 5.61
NISCHQ9Y2I1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.12■■■■■ 5.61
NISCHQ9Y2I1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.12■■■■■ 5.61
NISCHQ9Y2I1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
NISCHQ9Y2I1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
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