Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN8AQ9UQD0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms