Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO40Q9UH90 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms