Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NKX1-2Q9UD57 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX1-2Q9UD57 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms