Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DBF4Q9UBU7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms