Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXTL2Q9UBQ6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXTL2Q9UBQ6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms