Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTRRQ9UBK8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRRQ9UBK8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms