Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFIP11Q9UBB9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFIP11Q9UBB9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms