Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP35Q9P2H5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP35Q9P2H5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
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