Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MIS18AQ9NYP9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MIS18AQ9NYP9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms