Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM53CQ9NYF3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM53CQ9NYF3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms