Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDND1Q9NY35 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms