Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF3Q9NUQ8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF3Q9NUQ8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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